Если просто разрещающие правила, то примерно:
iptables -A FORWARD -p 250 -j ACCEPT
Если что-то нужно тонкое, то как обычно - прописываешь конкретизацию (например: -i eth0 , -o eth1 и т.п.)
Т.е. ничем другие протоколы, отличные от tcp/udp, особым не отличаются
"No! Try not! Do. Or do not. There is no try." -- Yoda