Во-первых не настраивается вид панели(мне нужен вид краткий. в тс и том-же мс енто есть).
Во-вторых приложение падает при копировании с пропусками(хотя мож уже и исправили).
В-третьих нет выделения правой кнопкой(shift и ctrl я считаю извращением а-ля проводник).
В-четвертых нет(или не нашел) подсчет занимаемого места каталогов. быстрый(в тс на пробел)
В-пятых эмулятор терминала что там есть неудобен, лучше его реализовать как в мс(ctrl+o - активная панель чудесным образом превращается в терминал. удобно для сборки программ)
В-шестых нет кнопок быстрого доступа к каталогам, закладки неудобны(см. gnome-commander)
В-седьмых нет поддержки плагинов(но енто не столь важно после всего выше перечисленного)
Ну еще плюс всякие мелочи не столь выжные.